直到九日傍晚才最终熄灭的这场席卷了整个文京区、台东区的大火，将东京的这两片城区几乎烧成一片平地，而作为轰炸目标最核心的东京帝国大学，则被从地面上彻底的抹掉，所有在校师生，校内储备的大量书籍、教材，以及日本最顶尖的教学和科研设备全部被烧毁。
存放在东京帝国大学校内的，由日本最尖端的核物理学家仁科芳雄，研制的日本第一台回旋加速器，连同这天晚上就住在东京帝国大学校内的东京理化研究所内的这位研制者，包括他最著名的学生，后世被称为日本雷达事业奠基人，正在日以继日忙着研制雷达的朝永振一郎教授，以及从德国搞來的雷达资料也一同灰飞烟灭。
这场轰炸，对于日本人來说无疑是一个不小的灾难，不仅单纯是丧生在轰炸引燃的大火之中的五六万普通百姓，还有储备了整个日本最尖端科研仪器的东京帝国大学被夷为平地，以及帝国大学内的上百上千的日本顶级科学家和大量的学生。
凌晨三点多，绝大多数人都在睡梦之中，而尚未完全转入战时状态的日本本土，甚至连防空洞的数量都不足，民众虽然多次做过防空演练，但是演练与实战是两码回事，再加上突然的袭击，直到轰炸完成全市也沒有拉响防空警报。
而炸弹的落点又是在整个东京市内最中心人口密集区域，造成这么大的伤亡也就不足为奇了，这还是抗联投弹的吨位不足，只有七十余吨的当量，毁灭的面积沒有那么大，如果换了载弹量更多的大型轰炸机，恐怕东京的损失还要巨大的多。
此次轰炸之中巨大的损失，让上至日本天皇，下至普通的东京居民都感觉到异常的震惊，从轰炸核心区域找到的烧焦尸体，堆积如山，流经轰炸区域内的几条河内也堆满了试图跳河逃避大火，却因为空气被大火吸光而窒息死的人。
一直生活在和平中的日本本土居民，终于领会到了什么叫做战争的恐怖，几年來中国大后方那些和平居民的遭遇，在首次降临到他们的头上，打开了潘多拉匣子的日本人，终于还是品尝自己酿下的苦果。
尽管在广播上，日本人对此次抗联对东京的轰炸，给予了最强烈的谴责，指责中国人是刽子手，恶意屠杀和平居民，只是日本人掀起的这番贼喊捉贼的舆论，却是遭到了全世界的一致耻笑。
开什么玩笑，中国那些城市遭受你们轰炸的还在少数吗，伤亡在日军飞机上投下的各种炸弹下的中国人，还在少数吗，从九一八事变后的锦州，日本人首开对城市进行无差别轰炸的记录。
到八一三淞沪会战开始后，日军对中国各大城市实施的无差别轰炸，到对重庆和大后方有恃无恐的大轰炸，现在自己挨炸了，反倒是指责别人轰炸和平居民，这是什么理论，恐怕全世界的人，只有日本人才能做的出來。
上海、南京、武汉、重庆、成都、西安、兰州、延安，甚至西宁、安康，大后方的那些城市哪一个沒有落下日本人的炸弹，自己被炸一次就急赤白脸的指责别人，典型的只许州官放火，不许百姓点灯的做法，不要脸之极，形容日本人可谓是恰如其分。
面对着烧成一片废墟的东京帝国大学，前來视察的日本首相东条英机久久的沉默，在返回首相官邸之后，第一个命令就是下令关东军、支那派遣军、朝鲜军，集中所有的飞机对抗联实施报复，只是日本陆海军航空兵大部分已经南下，能抽调出的作战部队相当有限。
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